MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 54558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_011312	CGT	2	6	3322355	3322360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209696452
54502	NC_011312	TAG	2	6	3322382	3322387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209696452
54503	NC_011312	TTG	2	6	3322430	3322435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209696452
54504	NC_011312	CCG	2	6	3322460	3322465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209696452
54505	NC_011312	TTG	2	6	3322466	3322471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209696452
54506	NC_011312	ATT	2	6	3322535	3322540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209696453
54507	NC_011312	T	7	7	3322539	3322545	0 %	100 %	0 %	0 %	209696453
54508	NC_011312	CTGA	2	8	3322609	3322616	25 %	25 %	25 %	25 %	209696453
54509	NC_011312	CTT	3	9	3322640	3322648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209696453
54510	NC_011312	AC	3	6	3322676	3322681	50 %	0 %	0 %	50 %	209696453
54511	NC_011312	TCT	2	6	3322684	3322689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209696453
54512	NC_011312	GAT	2	6	3322697	3322702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209696453
54513	NC_011312	TGTC	2	8	3322718	3322725	0 %	50 %	25 %	25 %	209696453
54514	NC_011312	TTC	2	6	3322764	3322769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209696453
54515	NC_011312	TAA	2	6	3322841	3322846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209696453
54516	NC_011312	AGAT	2	8	3322962	3322969	50 %	25 %	25 %	0 %	209696453
54517	NC_011312	AAC	2	6	3322977	3322982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209696453
54518	NC_011312	TTG	2	6	3323145	3323150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209696453
54519	NC_011312	TTAC	2	8	3323167	3323174	25 %	50 %	0 %	25 %	209696454
54520	NC_011312	TTC	2	6	3323177	3323182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209696454
54521	NC_011312	T	7	7	3323194	3323200	0 %	100 %	0 %	0 %	209696454
54522	NC_011312	TGT	2	6	3323325	3323330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209696454
54523	NC_011312	TCA	2	6	3323384	3323389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209696454
54524	NC_011312	CGTTGA	2	12	3323390	3323401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209696454
54525	NC_011312	TTG	2	6	3323446	3323451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209696454
54526	NC_011312	ATC	2	6	3323452	3323457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209696454
54527	NC_011312	ATG	2	6	3323490	3323495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209696454
54528	NC_011312	CGA	2	6	3323513	3323518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209696454
54529	NC_011312	AGA	2	6	3323519	3323524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209696454
54530	NC_011312	CAC	2	6	3323529	3323534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209696454
54531	NC_011312	ACGA	2	8	3323542	3323549	50 %	0 %	25 %	25 %	209696454
54532	NC_011312	ATC	2	6	3323677	3323682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209696454
54533	NC_011312	ATC	2	6	3323809	3323814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209696454
54534	NC_011312	TCA	2	6	3323837	3323842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209696454
54535	NC_011312	CTT	2	6	3323859	3323864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209696454
54536	NC_011312	GA	3	6	3323871	3323876	50 %	0 %	50 %	0 %	209696454
54537	NC_011312	CTT	2	6	3323919	3323924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209696454
54538	NC_011312	TG	3	6	3324051	3324056	0 %	50 %	50 %	0 %	209696454
54539	NC_011312	GAAC	2	8	3324077	3324084	50 %	0 %	25 %	25 %	209696454
54540	NC_011312	TTG	2	6	3324114	3324119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209696454
54541	NC_011312	GTT	2	6	3324146	3324151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209696454
54542	NC_011312	CATA	2	8	3324261	3324268	50 %	25 %	0 %	25 %	209696454
54543	NC_011312	CAT	2	6	3324297	3324302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209696454
54544	NC_011312	T	6	6	3324306	3324311	0 %	100 %	0 %	0 %	209696454
54545	NC_011312	TAA	2	6	3324324	3324329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209696454
54546	NC_011312	TTG	2	6	3324340	3324345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209696454
54547	NC_011312	TGT	2	6	3324350	3324355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209696454
54548	NC_011312	GAA	2	6	3324518	3324523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209696454
54549	NC_011312	CCT	2	6	3324539	3324544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209696454
54550	NC_011312	CAG	2	6	3324591	3324596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209696454
54551	NC_011312	ACGT	2	8	3324730	3324737	25 %	25 %	25 %	25 %	209696454
54552	NC_011312	CG	3	6	3324751	3324756	0 %	0 %	50 %	50 %	209696454
54553	NC_011312	CTG	2	6	3324783	3324788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209696454
54554	NC_011312	CTT	2	6	3324870	3324875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209696454
54555	NC_011312	CCA	2	6	3324899	3324904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209696454
54556	NC_011312	AGTA	2	8	3324949	3324956	50 %	25 %	25 %	0 %	209696454
54557	NC_011312	GCA	2	6	3324983	3324988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209696454
54558	NC_011312	ACC	2	6	3325012	3325017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209696454

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.